Ajakaiye trở thành nữ giáo sư vật lý đầu tiên ở châu Phi vào năm 1980. Bà đã dạy tại Đại học Ahmadu Bello và Đại học Jos, phục vụ với tư cách là trưởng khoa khoa học tự nhiên của Đại học Jos. Công trình của bà về geovisualization đã được sử dụng để xác định vị trí của cả khoáng sản và nước ngầm ở Nigeria.